辣椒雖然富含營養，又有重要的藥用價值，但食用過量危害人體健康。
因為過多的辣椒素會強烈刺激胃腸黏膜，使其高度充血、蠕動加快，引起胃痛、腹痛、腹瀉並使肛門燒灼刺痛，誘發胃腸疾病，誘發痔瘡出血。因此，凡患食管炎、胃腸炎、胃潰瘍以及痔瘡等病者，均應少吃或忌食辣椒。由於辣椒的性味是大辛大熱，
因此，牙痛、喉痛、咯血、瘡癤等火熱病症，或陰虛火旺的高血壓病、肺結核病，也應慎食。
另外，從中醫角度講，瘦人多屬陰虛和熱性體質，這一類人常常表現為咽乾、口苦、煩躁易怒，如多吃辣椒，不僅會使上述症狀加重，且容易導致出血、過敏和炎症，嚴重時還會發生瘡癰感染等。
